高压均质机依靠三个反复运动的柱塞而产生极大的压强，当柱塞向后运动时，进料下阀门开启，将物料吸入，当柱塞向前运动时，下阀门关闭，上阀门被顶开，物料被压入高压均质阀区域，通过一、二级均质阀均质、乳化，物料从出料口出去。
高压均质机主要由高压均质腔和增压机构构成。
高压均质腔的内部具有特别设计的几何形状，在增压机构的作用下，高压溶液快速的通过均质腔，物料会同时受到高速剪切、高频震荡、空穴现象和对流撞击等机械力作用和相应的热效应，由此引发的机械力及化学 效应可诱导物料大分子的物理、化学及结构性质发生变化，最终达到均质的效果。
因此，高压均质腔是设备的核心部件，其内部的特有的几何结构是决定均质效果的主要因素。
而增压机构为流体物料高速通过均质腔提供了所需的压力，压力的高低和稳定性也会在一定程度上影响产品的质量。
